สำนักงานกรมอุตุนิยมวิทยาญี่ปุ่น ประกาศเมื่อเวลา 00.15 น. วันอาทิตย์ (16 ม.ค.) ตามเวลาท้องถิ่น ซึ่งเร็วกว่าไทย 2 ชั่วโมง ว่าอาจมีคลื่นสึนามิสูง 3 เมตรพัดขึ้นฝั่งที่หมู่เกาะอะมะมิ และหมู่เกาะโทะกะระ ทางใต้ของประเทศการเตือนสึนามิดังกล่าวเกิดขึ้นหลังจากภูเขาไฟใต้น้ำใกล้ประเทศตองกา กลางมหาสมุทรแปซิฟิกปะทุขึ้นเมื่อช่วงก่อนเที่ยงของวันเสาร์ (15 ธ.ค.) ตามเวลาไทย
ทั้งนี้หลังจากกรมอุตุนิยมวิทยาของประเทศญี่ปุ่นประกาศเตือนภัยสึนามิในบริเวณทางตอนใต้ของเกาะอามามิและหมู่เกาะโทคาระในเขตจังหวัดคาโกชิมะได้เพียง 15 นาที ก็ปรากฏคลื่นสึนามีลูกแรกซึ่งมีความสูง 1.2 เมตร เข้าชายฝั่งที่บริเวณเกาะอามามิและโทคาระแล้ว
จากการประเมินของกรมอุตุนิยมญี่ปุ่น คาดว่าคลื่นสึนามิกำลังจะเข้าฝั่งอีกหลายลูกในบริเวณชายฝั่งตั้งแต่ฮอกไกโดจนถึงโอกินาว่า และมีความเป็นไปได้ที่จะมีความสูงถึง 3 เมตร โดยเป็นผลกระทบต่อเนื่องมาจากการระเบิดของภูเขาไฟใต้ทะเลที่ประเทศตองกา